【特约实践导师】 ——揭秘南大学子暑期科创实践之旅

发布于 2014-10-23点击数:1113

特约实践导师是校团委联合科技处、社科处共同邀请带有合适课题的老师们一起组建的实践师资队伍。导师通过招募具有学术实践热情与能力的南大学生(不限制专业)参与课题组,搭建跨专业的师生教学相长平台的形式,使得参与的同学扩展学术视野,得到尽早近距离接触学术科研以及相关实践的机会。带队老师以指导跨专业的学生进行学习的方式,使学生研究队伍得到进一步壮大。课题——“基因组学技术创新与在环境科学中的应用”——便是来自环境学院的特约实践导师张效伟老师通过这个平台带给同学们的。

该课题以R语言为基础,以江苏省杰出青年项目“研发基于DNA条形码的化学污染生态监测和风险预测技术”和国家基金委优秀青年基金项目“化学污染毒理基因组学”为依托,为太湖水域的所有生物建立起一整套基因组数据库,从而为该地区的水体及环境治理、生物多样性研究、水域开发及保护等方面奠定基础。张效伟老师选取适合同学们参与的课程实践环节,通过校团委“特约实践导师”平台面向全校学生进行招募,经过筛选最终将参与该项目暑期20余天科研实践活动的机会给了分别来自环境学院、社会学院的顾翔和丁紫瑄两名同学。

此次科研实践活动共分为三个部分。基础知识和技术培训,其主要目标是学习R语言。R语言是当今最前沿的程序设计语言之一,具有高效、便捷、操作性强等特点,广泛应用于生物、化学、环境、计算机、软件等领域,在数据分析、报表制作、程序开发等方面发挥着惊人的作用。经过近半个月的刻苦学习,参与的同学们能初步了解R语言的运行原理和基本思路,掌握一些语法和常用语句。如在数据库中查找特定的基因组序列、计算一段给定DNA序列的G-T含量并在不同窗口下绘制趋势图等。顾翔同学说:“差不多20天的时间里,我们从对R语言一无所知到能用R语言进行简单的编程来查询基因序列和基因预测。真的是非常的有成就感!”

图片一:R语言示例

 

二、与来访的美国德州农工大学的教授Professor Miguel进行学术交流。顾翔、丁紫瑄两位同学陪同Professor Miguel参观了南京博物院。一路上谈及德州农工大学和南京大学两所高校的渊源、各自家乡的风貌、对南京气候和城市建设的印象以及关于中国的历史文化和人文地理方面等问题。随后他们还一起参观位于老城区西南郊的大屠杀纪念馆。两位同学说,“这次实践让我们能够不闭门造车的学习,参加学术交流,还能够体验不同文化之间的交汇与碰撞,结交朋友,真是棒棒哒。”

                                                    图片二:张效伟老师和Professor Miguel及学生的合照  

三、进行太湖考察。太湖湿地是长江中下游地区最重要的生态系统之一,也是整个长三角生活生产用水的主要来源地之一,太湖水域的环境状况和这一地区的发展息息相关。然而近年来,太湖几乎每年都会遭遇蓝藻爆发、水质恶化,严重威胁着整个水域的生态平衡,也给附近地区的居民用水造成巨大压力,因此太湖问题一直是国内国际科研的一大热点。实践中丁紫瑄同学说:“早就听说太湖已经病入膏肓,可是我还是比较将信将疑的,但没想到实际情况更加严重,水藻腐烂,弥漫异味。治理太湖真是迫在眉睫啊!”此次实践活动正是试图结合高校科研实力和当地水资源管理部门的一手资料,为太湖水域建立完整的生物基因组数据库的一大创新。课题成果将便于生物多样性测定及保护,也为国内外的研究者提供强大、可靠的数据源。

 

                                                                      图3:太湖水华 

 张效伟老师在本次实践活动中对同学们提供了悉心指导,项目组同学收获很大,对张老师这份额外的付出非常感谢。张老师说:“这次实践活动让我感受到了南京大学的同学们在三三制本科教育体制改革下所迸发的创新意识和他们在这种成长环境中被激发出的科研热情,这种对于科研的热情恰恰是现代大学生所欠缺的。这次活动也让我收获了关于学生团队的指导管理经验以及和同学们之间的友谊,孩子们,你们真的很棒!”                      

  据了解,“特约实践导师平台”将邀请更多校内外导师对同学们进行各类实践的指导。     

                                               文/何宜轩 夏晓璇    图/顾翔